Dance Module Documentation

Contents

• pyCADD.Dance package
  • Subpackages
    • pyCADD.Dance.algorithm package
      • Submodules
      • pyCADD.Dance.algorithm.DL module
      • pyCADD.Dance.algorithm.consensus module
      • pyCADD.Dance.algorithm.default_params module
      • Module contents
  • Submodules
  • pyCADD.Dance.common module
    • Dancer
      • Dancer.__init__()
      • Dancer.add_pos_dataset()
      • Dancer.add_neg_dataset()
      • Dancer.add_dataset()
      • Dancer.get_merged_data()
      • Dancer.prepare_data()
      • Dancer.save_pickle()
      • Dancer.save_csv()
      • Dancer.save()
    • Matrix
      • Matrix.__init__()
      • Matrix.from_pickle()
      • Matrix.from_csv()
      • Matrix.from_splited_data()
      • Matrix.split_train_test_data()
      • Matrix.get_train_data()
      • Matrix.get_test_data()
    • Evaluator
      • Evaluator.__init__()
      • Evaluator.gbt_default_params
      • Evaluator.lr_default_params
      • Evaluator.rf_default_params
      • Evaluator.get_weights()
      • Evaluator.get_lr_default_params()
      • Evaluator.get_rf_default_params()
      • Evaluator.get_gbt_default_params()
      • Evaluator.load_params()
      • Evaluator.save_params()
      • Evaluator.search_params()
      • Evaluator.add_clf()
      • Evaluator.del_clf()
      • Evaluator.get_clf()
      • Evaluator.get_clfs_dict()
      • Evaluator.print_classifier_info()
      • Evaluator.repeat_cv()
      • Evaluator.print_cv_results()
      • Evaluator.testset_eval()
  • pyCADD.Dance.core module
    • hyperparam_tuning()
    • calc_scp_score()
  • pyCADD.Dance.metrics module
    • nef_score()
  • Module contents
• pyCADD.Dance.algorithm package
  • Submodules
  • pyCADD.Dance.algorithm.DL module
  • pyCADD.Dance.algorithm.consensus module
    • Average
      • Average.__init__()
      • Average.fit()
    • Mean
    • Geo_Average
      • Geo_Average.__init__()
      • Geo_Average.fit()
    • GeoMean
    • Minimum
      • Minimum.__init__()
      • Minimum.fit()
    • Maximum
      • Maximum.__init__()
      • Maximum.fit()
    • average()
    • minimum()
    • maximum()
    • std()
  • pyCADD.Dance.algorithm.default_params module
  • Module contents
• Dance User Guide
  • 数据准备 Data preparation
  • 建模与评估 Modeling and Evaluation

Indices and tables

• Index

• Module Index

• Search Page